На сайте ЕИС опубликованы разъяснения по вопросам включения в реестр контрактов сведений о контрактах по закупкам малого объёма (п. 4 и 5 ч. 1 ст. 93 Закона № 44-ФЗ). 

Для контрактов, сведения о которых включены в реестр контрактов, является обязательным: 
 - формирование с использованием ГИС ЕИС ЗАКУПКИ бюджетных, денежных обязательств, а также распоряжений о совершении казначейского платежа для заказчиков, лицевые счета которых открыты в органах Федерального казначейства; 
- указание идентификаторов (кода вида реестра, номера реестровой записи контракта, идентификатора документа о приёмке или этапа исполнения контракта) при формировании платёжного поручения для заказчиков, лицевые счета которых открыты в финансовых органах субъектов РФ (муниципальных образований). 

 Если данные условия соблюдаются, то сведения об оплате в реестре контрактов малых закупок формируются автоматически. 
 Поэтому способ отражения контракта в реестре контрактов (путём включения сведений в реестр контрактов малых закупок либо в виде сводного отчёта) необходимо определять до его оплаты. Если контракт был оплачен до включения в реестр контрактов, то его необходимо включить в сводный отчёт (пп. «у» п. 2 постановления Правительства РФ от 27.01.2022 № 60). 

Данная рекомендация применяется только для контрактов, заключённых без использования ГИС ЕИС ЗАКУПКИ.